sudo chmod 777 /var/lib/mysql

es-tu sûr de toi

Je veux dire par là qu'il y a probablement des problèmes de droit d’accès ou d'exécution à régler, donc ton point est certainement valide (je n'en sais rien car je n'ai pas installé PHPMyAdmin) mais il est
très risqué de changer des droits surtout de cette manière là qui donne à
n'importe quel utilisateur les droits sur
l'ensemble des fichiers de ce répertoire

Sur une machine exposée à internet comme l'est probablement le serveur Zentyal, cette approche rend la machine très sensible à n'importe quelle vulnérabilité qui viserait ce répertoire.
Mon conseil, à moins que le niveau de droit soit vraiment ce que tu décris, ce dont je doute un peu quand même, est que tu mettes ici le bon niveau de droit, soit en mettant l'utilisateur dans le groupe qui va bien soit en faisant tourner ton application avec l'utilisateur qui va bien.