Primero un backup que te permita restaurar el servicio en pocos minutos. Lo ideal, clonar el disco.
Ni se te ocurra intentar hacer un dist-upgrade. Ten en cuenta que, por ejemplo, Ubuntu no cambiará los repositorios de Zentyal lo que dejará tu sistema de roto.
Debes realizar el proceso desde el propio Zentyal. Realiza todos los updates necesarios para tener todos tus paquetes (de zentyal o del sistema) actualizados. Asegúrate de que todos ellos están en su versión más actual y comprueba que tu sistema de paquetes está sano. También debes comprobar que tienes espacio suficiente en la partición /boot. Comprueba que no hay errores en la base de datos de Samba con el comando
sudo samba-tool dbcheck --cross-ncs
y también MySQL con mysqlcheck. Asegúrate de que tu sistema está funcionando correctamente y que no hay errores en los logs.
Sólo después de ésto debes proceder a realizar el upgrade desde el propio zentyal.
En cuanto a OpenChange, creo recordar que el cambio se realizaba automáticamente.
Personalmente valoraría realizar una instalación de Zentyal 6.0 y migrar los datos. ¿Qué módulos utilizas? ¿Cuántos equipos y usuarios tienes?
Un saludo.