Hola aalvaro23.
Veo que somos varios los que estamos en el mismo intento de añadir Zentyal como DC adicional a un dominio Windows ya existente.
Yo he conseguido avanzar algo, pero sigo sin tenerlo operativo y tengo dos servidores pendientes de implementar dicha funcionalidad, en dos sites distintos de mi infraestructura.
Consejos:
1) Actualiza la versión de los paquetes, especialmente el de "Compartir ficheros"
2) Asegurate que tienes bien configurado todo el tema de DNS, sino es muy complicado que te funcione correctamente.
3) Establece como servidor NTP, un DC de tu infraestructura para sincronizar los relojes del servidor Zentyal con el dominio, sino da problemas en la validez de los tickets kerberos.
A ver si entre todos nos podemos ayudar y también un poco con la ayuda de los integrantes de Zentyal.
Si se consiguiera que Samba 4 funcionara en Zentyal con mediana calidad, sería un espaldarazo muy importante para el proyecto.
Saludos