Se bem entendi, este não é um comportamento normal.
Ainda assim, os diretórios "iniciais" do usuário no servidor não são iguais aos recursos compartilhados.
Eles podem ser configurados pelo samba mesmo como "somente leitura" e "não navegáveis" (execute o comando sudo testparm em seu servidor e consulte a seção "casas")
Esses diretórios não são os mesmos que hospedam os "perfis de roaming" de cada usuário, se habilitados. Eles são os mesmos que as "casas" das contas do servidor local e são necessários se o módulo PAM estiver habilitado (o que permite usar as contas de domínio como contas locais no servidor)
(O módulo FTP também tem uma opção que permite que você dê aos usuários acesso às suas casas, mas é até certo ponto uma anomalia)
Verifique se o diretório /home/user.registered existe em seu servidor e execute estes comandos para obter informações:
getfacl /home/user.registered
sudo testparm
net rpc share list localhost -User.registered% password
Use smbclient para tentar acessar a pasta:
smbclient //10.5.12.107/test -User.registered% password
Saúde!
PS: Que Camões perdoe o Google Translate e a mim por esse ataque à nobre língua portuguesa. : P