Зря обновлялись, это никогда не работало. У зенчала своя конфигурация для "своих" модулей и от версии к версии эти модули и конфигурации качественно и количественно меняются. Представьте ситуацию что в 4.2 у вас был модуль который успешно выпилили в 5.0 но задо понавпихивали новых... и как прикажете переносить конфиги когда одних уже некуда а другие неоткуда взять.
Если нужно обновить контроллер то поднимается второй, на него риплицируется база, всё настраивается, роли передаются, первый выключается. У виндей так-же если что.