Olá:
Acho que se vocé revisa a ferramenta samba-tool ela será de ajuda. Tenha em conta ainda assim que certas caracteristicas do Zentyal, como sao a quota, por ejemplo nao funcionaram inserindo usuarios deste modo (já que esta ferramente pertence ao software base (samba) e estas caracteristicas son adicionadas pelo codigo do Zentyal.
Voce tambem poderia olhar à API do Zentyal em github e usá-la para criar script que permitan realizar estas tarefas. Vocé pode olhar um ejemplo deste script na documentaçao publica (doc.zentyal.org), onda no apendice há um script para adicionar usuários a partir de um csv