La replicación debería detenerse al quitar el modo AD slave. Luego además en el servidor Windows deberías parar el servicio de sincronización de passwords.
Bueno, contando experiencias. El hecho es que ingresando directamente con la url
https://ebox-ip/ebox//Users/View/Mode cambié el modo a Master, cambiandolo del que estaba seleccionado que era AD Slave. Inmediatamente después de aplicar los cambios me aparecieron las opciones para crear nuevos usuarios y grupos, por lo que supuse que ya tenía independencia con respecto al PDC Windows. Si bien me permitía crear nuevos usuarios/grupos al transcurrir un momento los cambios que había hecho desaparecían.
Luego JA Calvo vi tu post que decía parar el servicio de Sincronización de passwords, y me dije "pero seguro, este es el problema, me sigue replicando".... fue así que detuve el servicio en Windows y lo cambié a inicio manual por las dudas, pero el problema persistía.
Reinicie Ubuntu para ver si de repente algunos de los cambios no me los había tomado y el problema siguió persistiendo.
Lo solucioné recién cuando hice lo siguiente volvi a activar el modo "AD Slave" y borre el contenido de los campos "AD password" y "AD secret key", guarde los cambios y posteriormente lo pasé a modo "Master" nuevamente y fue ahí cuando me empezó a respetar los cambios que realizaba en las cuentas de usuario.
Bueno, ahora tengo otro problema que es que no logro ingresar un pc XP al dominio, cosa que antes de la replicación funcionaba de maravillas con un solo usuario y grupo que cree a manera de prueba, pero esto ya no es tema de este post sino que en todo caso de otro.
Muchas gracias, y espero que mi experiencia sirva para la mejora de este brillante producto.
FD