Выяснил, что сервер не отвечал из-за того, что я физически отсоединял клавиатуру, мышь и монитор после установки и настройки Zentyal. Когда сервер переставал отвечать удалённо, я подсоединял клавиатуру, мышь и монитор обратно. Отсутствие сигнала с видеокарты - это результат того, что сервер был залочен, а сделать я ничего не мог, т.к. Ubuntu не поддерживает hotplugging (для меня это новость). Т.е. отсоединил клавиатуру и мышь, присоединил обратно, и они уже не работают. Такие дела... А выснил я всё это после того, как последний раз не стал лочить комп, и когда пропал Интернет, подсоединил клаву, мышь и монитор. На этот раз картинка рабочего стола появилась, а вот клавиатура и мышь так же не работали.
Итак, проблема: через некоторое время работы пропадает Интернет, причём сервер либо перестаёт пинговаться, либо нет. Возможно, останавливается или даёт сбой какой-нибудь модуль. Вот только понять бы какой. Отключение Traffic Shaping не помогло. А пока буду переезжать на 3.2.