Creo que el problema es que el usuario que se usa para correr bind9 no puede leer el archivo /etc/bind/rndc.key. Dicho archivo contiene la clave usada por defecto en bind9 y si no la puede leerla el inicio de este programa fallara.
Debes fijarte en los permisos del fichero y arreglarlos para que dicho usuario pueda leerla. Normalmente, el usuario en cuestiona es 'bind'.
Otra opción es usar eBox para gestionar tu servidor de DNS, para ello activa el módulo y el te gestionara la configuración.
Por último, si no piensas usar servidor de DNS puedes desinstalar bind9 y ebox-dns, olvidando así el problema.