Si te he comprendido bien, usabas vlan tagging para crear una vlan para un access point wifi.
Ya no usas el access point y has eliminado la vlan, pero obtienes un error relativo a la vlan eliminada cada vez que guardas lo cambios?
Si este es el caso, yo mismo estoy investigando un problema similar.
Tengo una copia de mi servidor en otro HW con un interface menos y también se me queja del interface que falta.
Si encuentro una solución, te la pongo por aquí.