1. Если вы поднимаете относительно простой почтовый сервер (имеется ввиду POP/IMAP/SMTP), а не монстрообразные почтовые сервера с веб-интерфейсом типа zimbra (хотя и это работает) - то вполне кошерно (хотя не знаю точно что значит кошерно). Так живет достаточно много проксей под *nix.
2. Без LDAP не взлетит, это точно! Причем у последней samba4 их аж два! Но бояться его не надо, это все-таки light-версия, бойтесь DAP
3. Кусков никаких нет, каждая машина - свой полноценный сервер, со своей, определенной инсталяцией, ролью. Дружить их с друг-другом не надо, это не виндовз.
4. сервер веб-морды (apache/httpd) живет на каждом установленном сервере, в том числе и на прокси. И этот очень хорошо,
безопасно и удобно. Особенно для ленивых админов (как я, например), которые не очень любят все конфигурить из командной строки.
Слово "загадочная" относиться к сфере применения вашей базы, а не к конкретному дистрибутиву БД под Linux