Es una buena pregunta, me ha pasado tambien pero no en todas las paginas.
Por ejemplo, en speedtest.net me aparece la IP publica, pero en algunos foros me aparece la IP privada, notablemente los vbulletin.
Hay un foro donde tambien soy moderador, me permite ver las IP's de los miembros, y cuando consulto mi IP aparece la IP privada!
Es algo curioso, pues desde que empezé a usar Zentyal ha sido asi.
Esto tambien se presentaba en versiones anteriores de Zentyal, y he intentado colocar mi router adsl2 en modo bridge y en modo router, pero sigue igual.
Tambien estoy usando proxy transparente.
De hecho creo que esto no es normal y debe haber una solución.
Saludos.