access.log создается ежедневно, access.log.(1-n) - это лог вчерашнего дня, зависит от того, на сколько дней ротируется лог самим squid. По логике, если логи сиабильно пишутся ежедневно (проверяется банальным tail -f /var/squid/logs/access.log), а в lightsquid данные не появляются, значит копаем конфиг lightsquid.cfg и смотрим с какого файла скрипт будет брать данные. За сбор отвечает cron, проверить расписание не помешает.