Olá,
Você pode usar o tutorial quando está usando o Windows 2003 sem qualquer problema... Para Windows 2008, é necessário usar o Kerberos, que é um outro meio de autenticação que assim como o NTLM irá usar o usuário que já está conectado ao AD para navegar pelo proxy...
Já tenho um passo a passo de como configurar o Zentyal para se comunicar com o AD 2008 através do Kerberos... Logo que sobrar um tempinho, vou publicar ele no trac.zentyal.org...
Abraços,
Jorge Quintão